凌雲禪寺開山院是凌雲禪寺第二任住持本圓大師於1925年(大正14年)興建，由於與一旁楞嚴寺為鄰，也有人稱此兩寺為子母院。最早是為來自福建的凌雲禪寺與西雲寺開山大師、老僧們安心潛修、傳承佛法，所以才命名為開山院。為台北西國三十三所巡禮的最終站，院內也設有台北西國三十三所靈場建設紀念碑及花山院法皇像。